Sekcija za molekularnu nauku o hrani organizuje predavanje
Dr Slobodan Jergić, University of Wollongong, UOW, Australia
Pogonska sila evolucije makromolekulskih kompleksa
Ponedeljak, 26. decembar 2016. u 12.00 časova, Svečana sala TMF, Karnegijeva 4/III, Beograd
Izvod predavanja
Escherichia coli poseduje pet DNK polimeraza pri čemu samo DNK polimeraza III holoenzim ima funkciju udvajanja (replikacije) hromozomskog DNK. U ovom izlaganju će biti opisan evolutivni odgovor bakterije na eliminaciju drugih podjedinica polimeraze III, koji dovodi do mutacija u osnovnoj podjedinici a koja obavlja sintezu DNK. Rezultati biohemijskih i biofizičkih ispitivanja sugerišu da mutacije stabilizuju podjedinicu a, a u cilju kompenzovanja izgubljene stabilnosti usled odsustva drugih podjedinica. Neočekivano, nivo stabilizacije mutacijama nije stohastičan već evolutivno predodredjen. Evolutivna superiornost nemutirane (nativne) polimeraze će biti diskutovana.
Biografija predavača
Dr Slobodan Jergić, rodjen u Beogradu 1968. godine, završio je X beogradsku gimnaziju (Mihajlo Pupin) 1986. godine - smer laboratorski tehničar za mikrobilošku hemiju. Školovanje nastavlja u SAD gde je diplomirao na Laguardia Community College-u u Njujorku na smeru kompjuter-programer. Vraća se u zemlju i otpočinje studje na Tehnološko-metalurškom fakultetu Univerziteta u Beogradu na smeru Biohemijsko inženjerstvo sa biotehnologijom gde je i diplomirao 1998. godine sa prosečnom ocenom 9,61. Kao inženjer tehnologije radio je najpre u kontroli kvaliteta u Pepsi Coli, a zatim i u unapredjenju proizvodnje u Stevan Still-u. 2003. godine dobija prestižnu stipendiju australijske vlade za doktorske studije (PhD) na Australijskom Nacionalnom Univerzitetu (ANU) u Kanberi. U grupi proferora Nick Dixon-a stiče zvanje doktora nauka 2007. godine sa tezom: Struktura i funkcija DNK polimeraze III Escherichia-e Coli. Iste godine prihvata postdoktorantsku poziciju na univerzitetu u Wollongongu (University of Wollongong, UOW, Australia), gde ostaje sve do danas. Do sada je objavio 27 naučnih radova objavljenih u svetski priznatim časopisima od kojih su najznačajniji:
- Elshenawy, M.M., Jergic, S., Xu, Z.-Q., Sobhy, M.A., Takahashi, M., Oakley, A.J., Dixon, N.E. and Hamdan, S.M. (2015). Replisome speed determines the efficiency of the Tus−Ter replication termination barrier. Nature, 525, 394–398. [IF: 41.46]
- Tanner, N.A., Hamdan, S.M., Jergic, S., Schaeffer, P.M., Loscha, K.V., Dixon, N.E. and van Oijen, A.M. (2008). Single-molecule studies of fork dynamics in Escherichia coli DNA replication. Nature Structural and Molecular Biology, 15, 170–176. [IF: 13.31]
- Berghuis, B.A., Dulin, D., Xu, Z.-Q., van Laar, T., Cross, B., Janissen, R., Jergic, S., Dixon, N.E., Depken, M. and Dekker, N.H. (2015). Strand separation establishes a sustained lock at the Tus–Ter replication fork barrier. Nature Chemical Biology, 11, 579–585 i naslovna strana. [IF: 13.00]
- Srivastava, M., Duan, G., Kershaw, N., Athanasopoulos, V., Yeo, J.H.C., Ose, T., Hu, D., Brown, S.H.J., Jergic, S., Patel, H.R., Pratama, A., Richards, S., Verma, A., Jones, E.Y., Heissmayer, V., Preiss, T., Dixon, N.E., Chong, M.M.W., Babon, J.J. and Vinuesa, C.G. (2015). Roquin binds microRNA-146a and Argonaute2 and regulates microRNA homeostasis. Nature Communications, 6, 6253 (pp. 1–13); doi: 10.1038/ncomms7253. [IF: 11.47]
- Cho, W.-K., Jergic, S., Kim, D., Dixon, N.E. and Lee, J.-B. (2014). Loading dynamics of a sliding DNA clamp. Angewandte Chemie International Edition, 153, 6768–6771. [IF: 11.26]
- Jergic, S., Horan, N.P., Elshenawy, M.M., Mason, C.E., Urathamakul, T., Ozawa, K., Robinson, A., Goudsmits, J.M.H., Wang, Y., Pan, X., Beck, J.L., van Oijen, A.M., Huber, T., Hamdan, S.M. and Dixon, N.E. (2013). A direct proofreader–clamp interaction stabilizes the Pol III replicase in the polymerization mode. The EMBO Journal, 32, 1322–1333. [IF: 10.43]
- Kath, J.E., Jergic, S., Heltzel, J.M.H., Jacob, D., Dixon, N.E., Sutton, M.D., Walker, G.C. and Loparo, J.J. (2014). Polymerase exchange on single DNA molecules reveals processivity clamp control of translesion synthesis. Proceedings of the National Academy of Sciences of the USA, 111, 7647–7652. [IF: 9.67]